MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 6849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008340	GGAC	2	8	652455	652462	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1502	NC_008340	GGGCC	2	10	653422	653431	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1503	NC_008340	GCGG	2	8	653442	653449	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1504	NC_008340	GCC	2	6	653465	653470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_008340	GAT	2	6	653477	653482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_008340	GCC	2	6	653485	653490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1507	NC_008340	CATTC	2	10	653495	653504	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1508	NC_008340	GC	3	6	653520	653525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1509	NC_008340	CG	4	8	653527	653534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_008340	CGAAG	2	10	653568	653577	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1511	NC_008340	CGG	2	6	654805	654810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_008340	GCA	2	6	658030	658035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_008340	GAG	2	6	658108	658113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_008340	CGG	2	6	658665	658670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_008340	GTT	2	6	658686	658691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_008340	A	8	8	658724	658731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_008340	GTCT	2	8	658784	658791	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1518	NC_008340	TCC	2	6	658810	658815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_008340	GTG	2	6	658857	658862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_008340	CCATT	2	10	658903	658912	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1521	NC_008340	CGC	2	6	658928	658933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_008340	GGT	2	6	658963	658968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_008340	CGT	2	6	660697	660702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_008340	CGA	2	6	660735	660740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_008340	CCCA	2	8	661082	661089	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1526	NC_008340	GCC	2	6	662694	662699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1527	NC_008340	CTC	2	6	664022	664027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_008340	A	6	6	664047	664052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_008340	CCG	2	6	664053	664058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_008340	GCG	2	6	664074	664079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_008340	T	6	6	664081	664086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_008340	GGT	2	6	664119	664124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_008340	GCC	2	6	664126	664131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_008340	CAA	2	6	664721	664726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_008340	GCCGG	2	10	665094	665103	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1536	NC_008340	GGCA	2	8	666920	666927	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1537	NC_008340	G	7	7	666939	666945	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_008340	CTC	2	6	668889	668894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_008340	GTGG	2	8	668904	668911	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_008340	GTC	2	6	668947	668952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_008340	AC	3	6	668965	668970	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1542	NC_008340	CCGT	2	8	671765	671772	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_008340	GCC	2	6	672054	672059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_008340	TC	4	8	672136	672143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_008340	CCG	2	6	673039	673044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_008340	AAC	2	6	677243	677248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_008340	AGG	2	6	680948	680953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1549	NC_008340	CTG	2	6	680967	680972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_008340	GGA	2	6	681773	681778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_008340	CTT	2	6	681788	681793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_008340	GGA	2	6	681833	681838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_008340	TGCC	2	8	686249	686256	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_008340	GCG	2	6	687253	687258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_008340	CGG	2	6	687270	687275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1559	NC_008340	GTG	2	6	687341	687346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_008340	TGG	2	6	687349	687354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_008340	AT	3	6	688773	688778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_008340	C	6	6	688802	688807	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1563	NC_008340	CGA	2	6	688836	688841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_008340	A	6	6	688851	688856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_008340	GCT	2	6	688865	688870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_008340	GCC	2	6	689011	689016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1568	NC_008340	CGG	2	6	689023	689028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_008340	TGCGCG	2	12	691811	691822	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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1571	NC_008340	GC	3	6	691869	691874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1572	NC_008340	GCC	2	6	691912	691917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1575	NC_008340	ACG	2	6	691992	691997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1590	NC_008340	TGA	2	6	696680	696685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_008340	TGC	2	6	697085	697090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_008340	ACC	2	6	697133	697138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1602	NC_008340	GCG	2	6	706327	706332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_008340	CAC	2	6	712295	712300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1604	NC_008340	G	6	6	712355	712360	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_008340	ATC	2	6	712397	712402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1608	NC_008340	GC	3	6	714144	714149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1609	NC_008340	CGG	2	6	714164	714169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_008340	CGG	2	6	714196	714201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_008340	GGCC	2	8	715505	715512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_008340	GCC	3	9	715535	715543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1613	NC_008340	GCCG	2	8	718402	718409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_008340	TGG	2	6	720252	720257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1617	NC_008340	GT	4	8	723048	723055	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_008340	CCGACT	2	12	723665	723676	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1619	NC_008340	C	6	6	723695	723700	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1620	NC_008340	CCCCAC	2	12	723717	723728	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
1621	NC_008340	GAG	2	6	723738	723743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_008340	GAG	2	6	723832	723837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_008340	GAG	2	6	723924	723929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_008340	G	7	7	723993	723999	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_008340	GAG	2	6	724016	724021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_008340	GAG	2	6	724110	724115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_008340	GAG	2	6	724204	724209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_008340	G	7	7	724273	724279	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_008340	GAG	2	6	724296	724301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_008340	CGC	2	6	724335	724340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1631	NC_008340	C	6	6	724374	724379	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1632	NC_008340	GAC	2	6	724387	724392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_008340	TTC	2	6	724429	724434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_008340	GGCC	2	8	724458	724465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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